#emtacl10: Bramer over presentation articles

Scientific output on Erasmus MC website and the use of XML: An easy way to manage and standardise the presentation of department’s journal articles
Wichor Bramer
(Erasmus Medical Centre Library)

twitter - weblogpresentatie

Erasmus publiceert 3000 artikelen in 2009

Wacht niet tot de gebruikers naar je toe komen, maar volg ze.

Onderwijs is ook veranderd, bibliotheek is ook geen stiltekamer meer, je mag er eten en drinken, alleen geen mobiele telefoon gebruiken. (wel als je niet belt hoop ik ;-) )

  • Begin klein
  • bespaar tijd voor je klanten

De afdelingen verzamelen de artikelen in METIS: daar zit een financiële reden achter. Maar voor de website wilden ze ook lijsten hebben, en er zijn meer dan 100 afdelingen. Allerlei afdelingen deden dat anders, en vaak wilden ze er wel een Pubmed link achter hebben per titel dus dat was nogal tijdverslindend.   En bovendien zit je vast aan de beperkingen van je systeem.

De manier van uitvoer is waarschijnlijk gemaakt via Endnote, en daar kun je gebruik van maken. Voor de mensen die Word gebruiken kun je via hubmed een nette referentielijst krijgen.  Het is eigenlijk best een gecompliceerde handleiding geworden.

De zoekacties deden ze via Scopus omdat je daar authorIDs hebt, daarmee helpt de bibliotheek. Die worden uitgevoerd naar Endnote. Via Endnote krijg je dan een XML en XMLT om een website te genereren.

Uiteraard zullen de meeste mensen niet naar de website gaan voor deze lijsten, maar als je gebruikers dat nou willen, waarom zou je dat dan niet doen?

  • multiple pages  via 1 XML document
  • XSLT per jaar splitsen

Is dit nou een goed idee om te doen. Dat is natuurlijk wel een open vraag. het is wel inside out.
Doen we het op de goede schaal? dat kan misschien wel aangepast worden

In de toekomst:

  • extract XML data to database
  • generate researcher pages with automated publication lists
  • import XML data into Metis financial reward system

Goede vraag van Pascal: waarom geen zoekactie op auteur doen en daarvan een RSS op de site zetten?
Ant; via  Pubmed kun je niet alles vinden. (Blijkbaar kun je via EndNote geen RSS feeds genereren)

——————————–

Vraag van mij die ik niet gesteld heb: waarom geen database?
Of: via RefShare zou je links naar  folders (per afdeling bijv) online kunnen zetten

#emtacl10: RefMobile

The impact of going mobile: RefMobile
Martin Blomkvist
(ProQuest)

RefmobileWorking with RefMobileTwitter

Refworks is in 2009 met een mobiele versie begonnen; het paste in hun scala van ontwikkelingen.

Web-based systeem van referentie management, in mei komt de nieuwe lay-out online. De huidige ziet er inderdaad wat ouderwets uit.

Er zijn meer dan 3 miljoen gebruikers, en ze hanteren 9 talen. Geen van de concurrenten heeft nog een mobiele versie. 80% van hn gebruikers hebben een hogere opleiding.

De vraag was: voor welk platform gaan we ontwikkelen?  Maar 3% gebruikt iphone, daarnaast veel anderen Blackberry, dus een web platform was wel voor de hand liggend om alle gebruikers te kunnen bereiken.

Wat wil je gebruiken op een klein scherm zien / wat heb je ‘onderweg’ nodig?

  • folders
  • alle references kunnen zien
  • toevoegen van references via smart ADD: toevoegen via Pubmed ID. ISBN of zoiets
  • kleine notes kun je toevoegen

Ze verwachten een forse toename van het gebruik aan het einde van het jaar. Het is gratis voor RefWorks gebruikers.

Eind dit jaar komt er een iPhone app voor.

De groepscodes mag uitgegeven worden aan je eindgebruikers.

Mobiele app: RefWorks

RefWorks is ook in mobiele variant te krijgen: er zijn geen speciale apps voor, maar het werkt zowel op de iphone als op de  Android (en ook op een telefoon met en internet toegang). Je kunt de site benaderen via http://www.refworks.com/mobile/ : dan zie je ook meteen hoe hij overkomt op de mobiel.

Je moet altijd met de Groupscode inloggen. De mogelijkheden:

  • zoeken alleen de quick search, niet de advanced
  • references en attachments kun je bekijken
  • folders toevoegen
  • zoek / bekijk per folder
  • de notes kun  je toevoegen
  • de folders kun je bekijken, toevoegen en wijzigen
  • via SmartAdd kun je referenties zoeken en toevoegen

Wat niet kan zijn de connecties met Word onderhouden, sorteren, settings aanpassen, records zelf wijzigen e.d. Uiteraard kun je ook geen file inlezen: daarvoor heb je de ‘full-version’ nodig.

Toevoegen van referenties gaat via ‘SmartAdd:

With SmartAdd, users simply enter basic identifying information for a publication, such as ISBN number, digital object identifier (DOI) number, partial title, or author and publication year, and SmartAdd searches the Internet for the reference and import it to RefWorks..

Als je gegevens via auteur + jaar invoert, krijg je soms een aantal mogelijke titels waar je uit kunt kiezen.  Het kan wel voorkomen dat de gewenste titel er niet bij zit: -ook bij zoeken op DOI-  in dat geval moet je ze via de full-versie toevoegen. Het is mijn ervaring dat niet alle artikelen die bijv. in Scopus zitten ook op deze manier te vinden zijn: waar RefWorks de titels vandaan haalt is me niet helemaal duidelijk -ik vermoed uit een Proquest database- , maar als hij ze vindt, zijn ze wel erg compleet.

Het werkt goed. Indien  je een foutje maakt wordt je zoekboxje roodomrand.
In mijn  testen is er een lichte discrepantie tussen wat het systeem via de ‘Quick search’ in de ‘full-version’ vindt en wat hij vindt in de mobiele versie, maar eigenlijk bleek de mobiele de juiste resultaten te geven. Prima dus.

Zie verder info van RefWorks:

Bibliotheken – Publicaties in November 2009

Er is tegenwoordig meer aandacht voor de architectuur van de bibliotheek, dan voor de bestaansreden van de bibliotheek zelf, zoals Johan Velter in een verder wat merkwaardige post opmerkt.
Er was een prima NVB congres, waar Zijlmo en  ik life hebben geblogd,  de Presentaties staan online en er zijn overzichten van oa  Ecobibl, Tenaanval en BiepmiepleenLaikas heeft zelf een praatje gehouden en daarover geblogd. Er is wel veel geTwitterd (Blogparty), en dat voegde tijdens het congres echt wat toe, maar ik heb niemand gezien met een Poken.
We mogen best wat trotser op ons werk zijn zegt Ziijlmo terecht en roept op om, wanneer je iets post over je werk als informatiespecialist, dan de tag #infospec mee te geven. Want onbekend = onbemind, en wie snapt nog wat wij eigenlijk doen?. (De WordPress spellchecker vindt het zelfs geen goed woord: informatiespecialist)

Het rommelt erg, er is van alles aan de hand:

Bibliotheken / informatiespecialisten

Open access / wetenschap / data

the collection of essays expands on the vision of pioneering computer scientist Jim Gray for a new, fourth paradigm of discovery based on data-intensive science and offers insights into how it can be fully realized

most consumers (80%) say they wouldn’t bother to access newspaper and magazine content online if it were no longer free …  not even micropayments

‘one-size-fits-all’ information and data sharing policies are not achieving scientifically productive and cost-efficient information use in life sciences

Boeken / tijdschriften / kranten

Citaties

In het algemeen geldt voor de sociale en geesteswetenschappen dat boeken tegenwoordig even belangrijk zijn als twintig jaar geleden. Tijdschriftartikelen hebben de plaats van boeken niet ingenomen, omdat beide publicatieformaten uiteenlopende doelstellingen dienen. Een zorgwekkende waarneming is dat in alle vier disciplines de gemiddelde citaatleeftijd van boeken verouderd is, dit in tegenstelling tot tijdschriften waar de gemiddelde leeftijd gelijk gebleven is.

Databases

  • Na een poos weer eens Refworks opgestart en het viel me niet mee. Het ziet er eigenlijk niet mooi uit, en erger: tot drie keer aan toe een dagenlang durende storing …   De risico’s van cloud computing worden zo wel erg aanschouwelijk.
  • Mobile Search of IEEE Xplore ® Digital Library Now Available Ik hoop wel dat ze wat aan de performance hebben gedaan: hun gewone zoekmachine is al zo traag

In november: Google / zoeken en Twitter / web 2.0 overzichtspost

Bibliotheken, google en zoeken augustus 2009 overzicht

Hmm, merk dat de animo wat taant. Veel hypes laat ik maar voorbij gaan … Ben aanzienlijk minder aan ‘t twitteren geweest en sla veel feeds over: of was er echt minder interessants?
Stanislav heeft via Hyves de gemoederen in elk geval wel flink in beweging gebracht over de privacy / veiligheid op internet: na een paar weken werd het op non-actief gesteld, maar het was wel lachen.

Dit hou ik deze maand over:

Bibliotheek / tijdschriften / boeken

Citaties

  • APA heeft nu een zesde druk en dus moeten we gaan nalopen wat ze nu weer voor futiliteiten hebben gewijzigd en zien of we de filters in Refman moeten passen (pff).  300 pagina’s om te vertellen hoe je een lijstje referenties moet maken …  – en nog wat voorschriften – is toch een beetje absurd, je kunt je zelfs afvragen hoe goed het is als je het zo ingewikkeld gaat opschrijven
  • Mendeley lijkt een zeer interessante optie te worden: moet misschien nog ietsje verder ontwikkeld. Zie ook lifehacker
  • Tot mijn verbijstering kun je nog steeds niet gewoon een behoorlijke direct import doen vanuit Scopus naar RefMan, omdat Scopus alleen in Unicode downloadt en RefMan alleen ANSI inleest … slechte zaak!

Google

I enjoy the massacre of ads. This sentence will slaughter ads without a messy bloodbath.

Internet

Research / Wetenschap

Twitter

  • Twitter had deze maand last van een serieuze DDos: lange tijd bleven allerlei apps niet werken, en het versturen van textberichtjes via SMS lukte niet meer
  • RSS to Twitter is a tool to enable you the ability to send RSS Feeds to your Twitter Account. Ha, in no-time zijn ze er ook weer mee gestopt, jammer wel.
  • 100 Serious Twitter Tips for Academics
  • Een aantal twiteraars hebben ondervonden dat een grote hoeveelheid berichtjes ineens verdwenen was. Wil je ze bewaren, dan heb je hier 10 Ways to Archive Your Tweets (RWW) . Een daarvan is Twistory dat kan toegevoegd worden aan google calender: daarmee heb je meteen en backup van je tweets, en een zoekmachine erop. Nadeel is dat het bij inlezen  maar 1 maand teruggaat: benieuwd of-ie tweets die verdwijnen op de lange duur vasthoudt
  • De zoekmachine in Twitter Search zoekt trouwens maar 2 weken terug! Met recht Real time …
  • Maar dat geeft niet, want een maf onderzoekje zegt dat 40% toch maar pointless babble is, en 37%’ just conversational’ .. hoe zouden ze die uit elkaar houden?

Web 2.0

Zoeken

Scopus downloaden naar Reference Manager

Waarom lukt het nog steeds niet de diakritische tekens uit Scopus goed in te lezen in Reference Manager?

Ik mopperde er al eerder over, en kreeg toen eigenlijk nul op het rekest.  Je zou toch denken dat dat inmiddels is opgelost, maar dat is niet zo. Scopus heeft nu in de ‘help’ het zinnetje toegevoegd:

Older versions of EndNote, ProCite and Reference Manger are not supported because records are using UTF-8 encoding.

Kijk, dat geeft aan waar het probleem zit. ANSI (ASCI)  was eigenlijk lang de standaard voor de tekensets (letters en cijfers) maar ik zie dat dat overal  steeds meer omgezet wordt naar Unicode (of UFT-8). Voor de gewone letters en cijfers is dat niet zo’n probleem, omdat de eerste 256 karakters hetzelfde zijn, maar voor de diacrieten maakt het wel uit.

Scopus biedt nu de mogelijkheid tot ‘Direct export” en dat is heel plezierig: een zoekactie lees je zo meteen in een RefMan database in. Alleen mag je dan hopen dat er geen Franse (Duitse) auteurs, titels, of tijdschriften bijzitten,  want dan heb je een  probleem: een auteur als Côté bijv. is niet behoorlijk in te lezen.

Als Scopus nu de mogelijkheid zou bieden om te exporteren in ANSI formaat, of als RefMan bij de RIS importfilter aangeeft dat dat aan te passen is, was het opgelost. Maar dat doen ze niet.

Wat je nu moet doen is het export bestandje opslaan, openen in Notepad, bewaren als ANSI en daarna pas inlezen in RefMan.   Ook voor versie 11, de update die we niet zo lang geleden hebben aangeschaft. Dan gaat het wel goed, maar echt gebruikersvriendelijk is het natuurlijk niet.

EndNote is sinds versie 8 compliant met UFT-8, dus die heeft daar geen probleem mee:  RefMan en Procite wel. Het ziet er naar uit dat de leverancier RefMan aan het afbouwen is: 8 jaar geleden presteerde het beter dan EndNote, nu niet meer: zie bijv   Endnote X2 versus Reference Manager 12.

Wat te doen? Het was al zo moeilijk om onze ICT te overtuigen om RefMan in het netwerk op te nemen, omzetten naar Endnote , ai… En dan is er nog Refworks, maar dat is niet alleen aanzienlijk duurder, het geeft ook firewall problemen in de combinatie met Word. Zotero is ook geen optie, want ze zijn bij ons Windows-hooked, en Zotero is een firefox applicatie.

Nog even en we kunnen het misschien allemaal wel overslaan en naar Mendeley overgaan….

Juli overzicht

Bibliotheek

For Denmark, the United Kingdom and the Netherlands free access to scholarly materials could offer significant benefits not only to research and higher education but also to society as a whole. This has been calculated by Australian economist Professor John Houghton in studies which have taken place in these three countries on the costs and benefits of scholarly communication. He has now summarised these findings in a report commissioned by Knowledge Exchange, which is a partnership of the IT bodies from Denmark (DEFF), the United Kingdom (JISC), the Netherlands (SURFfoundation) and Germany (DFG).

  • Intimidated by library and librarian:  Too difficult to use -  Takes too long – Stereotypes
  • People do not think of the library as an important source of electronic information! :-(
  • What libraries can do: “Make library catalogs more like search engines…”

Citaties:

Google

Internet

Research

Twitter

Web 2.0

Zoeken

The web is alive with real-time information. So why search a stale archive? Collecta monitors the update streams of news sites, popular blogs and social media, so we can show you results as they happen. Give it a try.

... van die dingen dus … &  that’s not all there is to read  for a librarian who’s trying to stay informed …

European Reference Index for the Humanities (ERIH) – quote

Naar een Europese citatie-index? is een interessante post van Peter van Laarhoven op Weblog I&C.

Van Jeroen Bosman hoorde ik dat  Scopus zich  zich in z’n Arts & Humanities (A&H) uitbreiding van vorige week baseert op de European Science  Foundation (ESF) lijsten,  de European Reference Index for the Humanities (ERIH).

Lezen van de hele log van Peter is aan de bevelen, enkele quotes daaruit:

De bekende citatie-indexen die samen Web of Science uitmaken nemen tijdschriften in andere talen dan het Engels te weinig serieus. Dat is een vrijwel onbetwiste vaststelling. Vooral de geesteswetenschappen hebben er last van, plus delen van de gammawetenschappen. …. De initial lists zijn als pdf-files gepubliceerd, wat het wat lastig maakt om hun inhoud en dekking naar land en taal van publicatie in kaart te brengen. Daarom heb ik ze omgezet en samengevoegd in een grote spreadsheettabel, waarin je simpel kunt filteren op de verschillende gegevens

Verslag Research Evaluation presentatie (Thomson Reuters)

Ann Kushmerick manager research evaluation and bibliometric data, is net van Philadelphia ingevlogen en geeft de presentatie. Bijeenkomst georganiseerd door Thomson Reuters en gehost bij UBVU 22 juni 2009.

Agenda: Waarom bibliometrie? Waarom WOS, en  Gebruik Nieuwe ISI tools, InCites / ResearcherID

Research cycle: search & discovery / Write & publish / Evaluate / Manage research output.
TR wil op al deze velden actief zijn. Zowel voor onderzoekers zelf, als bibliothecarissen als beleidsmakers.

Trends:

  • competing funding is stijgend
  • competition research faculty is stijgend
  • effectiever gebruik van bronnen

Waarom: o.a.: weten waar je nu staat, waar je geweest bent en waar je heen gaat, en om degenen die erg goed zijn te belonen.

Belang van meten (meten = weten): dan kun je iets van je onderwerp zeggen.

Waarom bibliometrie

  • quality assessment
  • indicatie van impact
  • kwantitatieve analyse moet peer review niet vervangen
  • performance indicators die transparant en reproduceerbaar  zijn

Citation metrics

  • zijn maar onderdeel van geheel van research performance
  • je moet niet naar een enkel getal kijken: verschillende methoden laten andere zaken zien, combineer ze
  • zijn maar net zo goed als de bron waaruit ze komen

Cover WoS:

  • ambitie niet alle tijdschriften op te nemen maar de belangrijkste
  • wel over hele breedte wetenschappen
  • consistent
  • > 42 million records, 11000 tijdschriften
  • Conference proceedings 120.000 zijn laatst ook erbij gekomen
  • 105+ jaar  ( is idd sterke punt van hen)

University rankings

JCR wordt 1x per jaar geactualiseerd en is vrijdag ge-updated

Nieuwe databases van ISI

  • Chinese scince citation
  • Biosis citation index
  • Century of social science (nu ook terug tot 1900)

Conference proceedings

  • Zowel voor de sciences als voor de social sciences
  • Waarom? Omdat ze voor de onderzoekers erg belangrijk zijn: sommige disciplines (engineering) kijken meer naar deze publicaties dan naar officiële tijdschriften, en omdat nieuwe info hier eerder in komt.
  • Terug tot 1990
  • Geïncorporeerd in WoS
  • Citaties in WoS tellen nu ook de proceedings mee (“this article is citated 288 times in Wos, 26 of those in Conference Proceedings”)

In WoS nu ook:

  • funding acknowlegements. Sinds vorig jaar. apart veld. Analyze results: top auteurs, instituten en disciplines. geen plannen om oude data daarin toe te voegen, maar zou wel kunnen.

WoK tools zijn verbeterden er zijn plannen

  • Citation report. Limiet 10.000 records voor een citation report. Van plan on gecombineerde citation reports te maken over heel WoK
  • Scorecard (komt er aan)
  • Map (visualisatie, ook om bijv trends te laten zien, visualiseren per jaar/auteur bijv. ))

H-index

  • heeft geen vast startpunt in WoS, maar gaat zover terug als je instituut een abonnement heeft (eigenlijk is dat wonderlijk, want daarmee wordt de h-index van WoS ook weer niet uniform )
  • sterk afhankelijk van discipline, vergelijk ze niet onderling
  • afhankelijk van leeftijd auteur en aantal artikelen die deze geschreven heeft, geen rekening met artikelen die heel erg veel invloed hadden
  • gaat alleen omhoog, nooit omlaag, ook al publiceer je niet meer

(nu aan de koffie)

10 commandments of publishing / citation analysis

  1. available data can address question
  2. choose field definitions
  3. whole or fractional counting
  4. require editing (misleading  data,  consider negative and self-citation)
  5. compare like with like (vergelijk geen verschillende disciplines)
  6. use releative measures
  7. recognize skewed nature of citations
  8. obtain multiple measures (citatie patronen: weinig wordt veel geciteerd, veel door weinigen)
  9. confirm data collection relevant to question
  10. ask wheter results are reasonable

Journal of citation reports (JCR)

  • field differences heeft invloed op Impact Factor: normale IF  gaat over 2 jaar impact, maar sommige disciplines  hebben een ander citatie patroon: dan is de 5-jaar impact handiger. In mathematica of geologie bijv is 5-jaar index van een tijdschrift vaak hoger
  • 80% van tijdschriften heeft minder dan 20% self-citatie
  • EigenFactor score toegevoegd, daarmee hangt score niet van tijdschrift af, maar staat ertikel op zich
  • oneigenlijk gebruik van IF. IF is nooit bedoeld als beoordeling van een auteur, maar van een tijdschrift
  • elk instituut heeft eigen behoefte en er worden ook heel verschillende soorten rapporten gemaakt

Relative impact measures

  • journal actual, category, mean percentile
  • ze geven ook ruwe data waarmee mensen zelf statistieken kunnen maken

Incites

  • nieuwe tool, gaat terug tot 1981
  • comparative data: rank and compare countries bijv. Analyseer productie per land per jaar over 5 jaar. Zoek naar trends, laat zien hoe je zelf scoort ten opzichte van de baseline. Lijkt op wat cwts doet, maar ze rekenen ietsje anders. Dat kun je ook voor instituten / universiteiten doen. Benchmarking, vergelijk instituten maar ook: vergelijk performance
  • research performance profile data. Data gaat terug tot 1981 Overzichten.
  • werkt met WoS maar is een apart abonnement
  • in NL heeft alleen Utrecht nog een trial

Wat kun je bijv met Web InCites:
Nagaan ‘What is a researcher’s impact’ en Management informatie

  • van een groep allerlei soorten metrics samenvatten, inzoomen op een auteur.
  • je kunt in een regel zien hoe een artikel scoort en ook wat de te verwachten score is in vergelijking met het tijdschrift en de categorie: dan heb je in een oogopslag een vergelijking van hoe iemand het doet, beter of slechter dan gemiddeld
  • 2nd generation citation counts: indirecte impact.
  • dat kun je ook samenvatten over alle publicaties van een auteur
  • omdat het genormaliseerde getallen zijn, kun je het vergelijken met totaal andere disciplines en zelfs het hele veld in een bepaald land bijv.
  • trend analyse: nagaan of/waarom er een bepaalde daling/stijging  in een bepaalde tijd is. Publication trend / Citation trend
  • analyseer de uitkomsten van samenwerking met andere instituten

ReseacherID

Profiel: creëert een  uniek nummer voor een onderzoeker met daarin naam en instituut etc.  Ook door/voor mensen die niet op WoS geabonneerd zijn, maar als je abonnement hebt, wordt de h-index ook getoond. Deze data kan ook toegevoegd worden aan InCites.  Profielen kunnen ook en masse geproduceerd worden door de bibliotheek bijv. Profiel kan openbaar of privé zijn: als je het openbaar maakt, komt er een lijst met publicaties bij.  Maar die lijsten moeten ze wel zelf bijhouden. Zou wel handiger zijn als ISI een berichtje gaf als ze een nieuwe publicatie van iemand vonden en een seintje gaven om het up-to-date te houden.

Hoe verhoudt het zich tot nationale activiteiten als DAI? Ze vinden wel dat er samengewerkt moet worden, maar blijkbaar is dat dus nog niet het geval. (Metis mensen: actie, neem contact op met hen!)